De NAV organiseert jaarlijks een tweedaagse wetenschappelijke vergadering. Deze twee dagen zijn gevuld met een gevarieerd aanbod aan lezingen en een poster presentatie over actueel wetenschappelijk onderzoek. De lezingen worden meestal georganiseerd rondom bepaalde themata. Tijdens de lezingen is er aandacht voor de anatomie van het betreffende thema, gerelateerd wetenschappelijk onderzoek en gerelateerde klinische aspecten. Omdat veel leden van de vereniging affiniteit hebben met onderwijs komen in lezingen ook onderwijs aspecten van het vakgebied anatomie aan bod.
Daarnaast is er tijdens de wetenschappelijke vergadering tijd ingeruimd voor de algemene ledenvergadering en natuurlijk ook voor het uitwisselen van informatie met collegae.
Eén van de hoogtepunten van de bijeenkomst is de zogenaamde Bolk competitie. Aanstormend onderzoekstalent, nog niet gepromoveerd of zeer recentelijk gepromoveerd, probeert daarbij de prijs voor de beste voordracht in de wacht te slepen. Indien men geïnteresseerd is om tijdens de wetenschappelijke vergadering een poster te presenteren of mee te doen met de Bolk competitie, dan kan men contact opnemen met de secretaris van de vereniging.
Het Congres van 2020 zal doorgaan op vrijdag 3 en zaterdag 4 januari 2020.